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標(biāo)題:
前沿科技之生物計(jì)算機(jī) 能破譯DNA芯片圖像
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作者:
掃街
時(shí)間:
2012-2-16 13:04
標(biāo)題:
前沿科技之生物計(jì)算機(jī) 能破譯DNA芯片圖像
據(jù)美國(guó)物理學(xué)家組織網(wǎng)2月8日(北京時(shí)間)報(bào)道,美國(guó)加州斯克里普斯研究院和以色列理工學(xué)院科學(xué)家開(kāi)發(fā)出一種生物計(jì)算機(jī),目前可用于破譯存儲(chǔ)在DNA芯片中的加密圖像。這是首次通過(guò)實(shí)驗(yàn)演示基于DNA計(jì)算的分子圖像密碼系統(tǒng)。相關(guān)論文發(fā)表在最新一期《應(yīng)用化學(xué)》上。
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電子計(jì)算機(jī)由硬件、軟件、輸入和輸出4個(gè)部分構(gòu)成,輸入、輸出的是電子信號(hào),硬件是各種金屬、塑料、導(dǎo)線、晶體管的復(fù)雜組合,軟件是一系列電子信號(hào)形式的機(jī)器指令。而生物計(jì)算機(jī)這4個(gè)部分全是分子,所有生物系統(tǒng)甚至整個(gè)有機(jī)生物界、每個(gè)人都是一臺(tái)生物分子計(jì)算機(jī),其硬件和軟件是復(fù)雜的生物分子,分子之間能有邏輯地進(jìn)行“交談”。它們互相激活,執(zhí)行某個(gè)預(yù)定的化學(xué)反應(yīng)。輸入是一種經(jīng)過(guò)特殊預(yù)定變化的分子,遵循一套特殊的法則(軟件),這種化學(xué)計(jì)算過(guò)程的輸出,是另一種明確規(guī)定好了的分子。
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新開(kāi)發(fā)的生物計(jì)算機(jī)是把化學(xué)成分和一種裝有溶液的管子連接在一起,溶液中混合著各種不同的小DNA分子、經(jīng)過(guò)選擇的DNA酶和ATP(三磷酸腺苷)?!斑@是一種清澈的溶液,你看不到任何東西?!鳖I(lǐng)導(dǎo)該研究的以色列理工學(xué)院教授艾胡德·柯南說(shuō),“當(dāng)分子開(kāi)始相互作用,我們就可以靜候結(jié)果。還可以調(diào)整混合液中DNA和DNA酶改變處理過(guò)程,以得到想要的結(jié)果?!?
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生物計(jì)算機(jī)是根據(jù)圖靈機(jī)的模型設(shè)計(jì)的,圖靈機(jī)的操作與DNA鏈極為相似。閱讀開(kāi)端從一個(gè)字母到另一個(gè)字母,在每個(gè)位點(diǎn)都執(zhí)行4步操作:閱讀字母;用另一個(gè)字母替代該字母;改變它的內(nèi)部形態(tài);移動(dòng)到下一個(gè)位置。一張指令表就是翻譯規(guī)則或翻譯軟件,指示這些操作?!拔覀兊脑O(shè)備是圖靈機(jī)的簡(jiǎn)化版?!笨履险f(shuō)。
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柯南還指出,對(duì)于傳統(tǒng)計(jì)算任務(wù)而言,電子計(jì)算機(jī)速度更快、更可靠,生物計(jì)算機(jī)的主要優(yōu)勢(shì)在于其生物特性。人們能把大量信息經(jīng)過(guò)加密存儲(chǔ)在DNA芯片中,生物計(jì)算機(jī)處理單個(gè)步驟雖然比電子計(jì)算機(jī)要慢,但它能平行處理數(shù)萬(wàn)億的化學(xué)步驟,使整體計(jì)算過(guò)程非常快?!斑@種技術(shù)讓我們能在一個(gè)芯片中印上數(shù)百萬(wàn)像素,經(jīng)過(guò)加密后,這種芯片能存儲(chǔ)的圖像數(shù)量可以達(dá)到天文數(shù)字。”
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此外,這種設(shè)備能直接和生物系統(tǒng)甚至活的有機(jī)生物相互作用,因?yàn)榉肿佑?jì)算機(jī)的4個(gè)組成部分之間都不需要接口,溶液中的分子會(huì)以一種瀑布般方式按照編好的程序進(jìn)行化學(xué)反應(yīng)。
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